同構實驗室的下一代IsoDDE引擎推動AI驅動的複雜且難以攻克分子設計

簡要介紹

IsoDDE 被呈現為一個下一代人工智慧平台，旨在推動計算藥物發現的進步，通過提升預測準確性、擴展目標範圍，以及創造適用於複雜生物系統的新化學物質。

同構實驗室（Isomorphic Labs）是谷歌DeepMind的分支公司，已於2026年2月推出IsoDDE，該系統被描述為目前公開披露的最先進的計算藥物設計人工智慧系統。

該平台定位為一個完整循環的計算引擎，超越了AlphaFold 3的結構預測焦點，旨在解決數字藥物開發流程中長期存在的多項限制。

據公司表示，IsoDDE設計用於泛化到不熟悉的生物系統，能在不依賴傳統物理模擬的情況下預測結合親和力，識別隱藏的調控口袋，並能有效與抗體及其他複雜生物分子協作。

在內部項目中，同構實驗室報告稱，IsoDDE已用於解讀先前未被描述的結構、檢測未經實驗標註的口袋，以及為被認為難以藥物化的目標生成新化學物質。該系統被描述為一個統一的計算框架，旨在彌合結構預測與實際藥物設計任務之間的鴻溝，並提供公司聲稱超越早期深度學習和物理基方法的準確度。

該平台的開發是在2024年AlphaFold 3發布後，人工智慧驅動的分子建模快速進展的背景下進行的。儘管該模型顯著推進了蛋白質-配體結構預測，但尚未完全解決將計算方法應用於實際藥物發現流程的挑戰，因為模型必須處理多樣的生化特性並推斷超出訓練分佈的系統。IsoDDE旨在彌補這一空白，提供一個可擴展的基礎，能夠探索未被開發的生物和化學空間。

同構實驗室表示，IsoDDE已經整合到與主要製藥公司的合作中，該平台負責進行計算設計與預測，而合作夥伴則進行實驗驗證和臨床開發。公司也持續擴展其內部研發管線。在2025年至2026年間，獲得了大量投資，包括2025年3月的6億美元融資，並正準備多個專有分子，主要用於腫瘤學，進入臨床試驗。

IsoDDE被呈現為一個下一代計算引擎，旨在提升預測準確性、擴展可藥物化的目標範圍，並加快從分子建模到實驗驗證治療候選物的轉化速度。

IsoDDE 標誌著人工智慧驅動藥物設計的新基準

IsoDDE 被描述為在預測準確性和功能範圍方面的重大進展，提供了對控制人類生物學的分子系統的更詳細理解，並改善了針對這些系統的化合物設計。

在同構實驗室的持續研究項目中，該平台被常規用於解讀未曾描述的結構、檢測未經實驗識別的口袋，以及生成針對具有挑戰性的治療目標的新化學物質。

公司指出，未來將持續推進計算藥物設計的邊界，並計劃將這些增強的能力應用於歷來被認為困難的藥物發現領域。